与传统进出口企业相同，跨境电商企业一旦被海关稽查查发问题，同样会面临补税、罚款以及追究个人刑事责任的处罚，同时信用等级下调，正常通关活动受限，企业利益因此受到损失。

除了上述共性的风险之外，跨境电商企业面对海关稽查时还要注意防范以下风险：

风险之一，因为跨境电商企业现在新政之前无需接受海关稽查，但新政之后必须面对被稽查，普遍缺乏对这一新生风险的认识和应对经验，对于海关稽查的权限范围和企业在配合稽查时拥有的权利和应承担的义务都缺乏了解，处于先天劣势。

风险之二，相对于跨境电商企业已经熟悉的海关前期监管而言，海关稽查的自由裁量权范围要大得多，稽查哪家企业、何时稽查、稽查企业的哪些业务都完全由海关掌握，具有不确定性，企业无法了解海关稽查的思路、方法，处于被动境地。

风险之三，相对于针对每一票具体货物实施的前期监管而言，海关稽查是对跨境电商企业一定时间范围内进出口业务实施的全面核查，涉及面广，涵盖海关监管关注的各类风险点，一旦查发问题，将不仅局限于某一票货物，可能造成的后果更加严重。

风险之四，海关稽查可以对企业的财务账簿、凭证等进行核实，这在前期监管环节无需向海关提供，跨境电商企业如果不掌握海关在财务管理方面的要求，将可能因为报关记录与财务记录、业务记录以及货物情况不符而遭受处罚。

面对上述风险，我们建议跨境电商企业充分研究和了解海关稽查的思路和方法，重点在以下几个方面做好应对准备：

一是价格。由于价格的高低直接关系到缴纳税款的多少，因而一直是海关稽查（不只针对跨境电商企业）关注的重点，而就跨境电商来说，价格还与“个人年度限值”问题有关，价格的高低在年度限值内影响税款多少，而在限值外直接影响适用不同税率，所以，海关稽查时对跨境电商企业进口商品的价格会更加关注。

二是归类。归类可能带来三方面的影响：一是直接关系到商品是否可以归入正面清单，如实际不可归入而伪报成清单项下商品，将直接作为走私处理；二是涉及到清单列明商品的特别排除规定，比如配额商品、特殊食品、密码产品等等被排除在外；三是关系到适用税率不同，影响征收税款的多少。海关稽查时针对这三个方面都会进行核实。

三是原产国。尽管电商新政中没有单独针对原产国做出规定，但是，由于政策规定“超过单次限值、累加后超过个人年度限值的单次交易，以及完税价格超过2000元限值的单个不可分割商品，均按照一般贸易方式全额征税”，而按照一般贸易方式征税时原产国的不同将影响到适用税率的不同，海关稽查时同样会予以关注。

需要强调的是，价格、归类和原产地，不仅是海关稽查时会重点关注的问题，即使是在一般通关环节，海关也要求跨境电商企业如实申报，并提交相应的证明单据，进行重点审核，如果查发问题，也可能被处罚。